- Area A.01 - Affari e Coordinamento Attività della Direzione Generale
- Area A.02: Gestione risorse umane e strumentali – Legalità e Trasparenza
- Area A.03 - Area legale e contenzioso – Contratti
- Area A.04: Area economico-finanziaria e Programmazione fondi comunitari, nazionali e regionali
- Area A.05: Sistema di controlli interni - Controllo di gestione - Monitoraggio e controllo fondi
- Servizio S.01 - Servizio Idrico Integrato - Dissalazione e Sovrambito
- Servizio S.02 - Concessioni Idriche
- Servizio S.03 - Dighe
- Servizio S.04 - Governo del Sistema Rifiuti e Impiantistica
- Servizio S.05 - Bonifiche
- Servizio S.06 - Autorizzazioni Rifiuti